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如何自学生物信息学
1、一门脚本语言,个人推荐python(Perl也可以,各有利弊,Python更新兴一些)。Linux系统。这个也不是百分百要求,但是专业的生信人,都是用Linux的,而且很多软件都是不支持Windows的。
2、有了基础知识的铺垫,就可以尝试着自己做些练习了,paper上面都会给出他们的数据、原码地址,可以找来自己试试,先看看自己能不能做出一样的效果。当然,这时要是你手里正好有项目,那就更好了。
3、参加课程或培训:参加一些线上或线下的课程或培训,例如Coursera上的生物信息学课程、培训班、讲座等,了解生物信息学分析的流程和方法,掌握实践技能。 实践和练习:通过实际项目的实践,积累经验和技能。
4、如何从零开始掌握生物信息学分析 生物信息学在短短十几年间,已经形成了多个研究方向,以下简要介绍一些主要的研究重点。
生信小白学习系列:如何进行基因组组装?(1)
重叠序列相连 简单来说这种算法就是将所有的reads拿出来,相互比对,找到重叠的reads,然后构建长的连续的contigs,最后再将contigs组在一起形成scaffolds。
这时,只要把biopython从78降到77就可以了 命令:conda install -y -c conda-forge biopython=77 就可以覆盖安装了,而且神奇的是安装完就可以使用了,输入 busco -h 不会报错。
建立基础知识:先学习生物学、计算机科学和统计学的基础知识,掌握常用的生物学术语和基本的编程概念。可以参考一些经典教材如《生物信息学导论》、《R语言实战》等。
学习生物信息学,需要配置怎样的电脑呢?
1、安全柜:这里说的安全柜为生物安全柜,根据国家规范要求,二级生物安全实验室必须配置1台安全柜。这是一种隔离设备,作用是防止实验室内的有害悬浮微粒扩散,能够提供对工作人员、实验样品、实验室内环境的全面保护。
2、配置建议 (1)处理器:i5-5200U以上,例如i5-6300HQ(高压版性能高,但多用于游戏本)、i5-7500U(建议)。(2)显卡:GT系列以上,例如GT920MX、GT930MX、GT940MX(建议),更高性能的有GTX940M、GTX950M等。
3、CPU,至少2核。因为你在运行程序时,通常100%占到CPU,如果没有2核,计算机多半会***死在那里。如果有8核,或者以上更好。GPU,很多程序开始使用GPU运算,如果能有好的GPU显卡,也是推荐的,但不是必须的。
4、如果是个人分析一些小的生信项目,同时又可以买组装电脑,那下面这个配置我觉得是很好的。
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